Bio2m Plateform


CHU-MTP

Collaboration de recherche ou de R&D

  • Partenariats scientifiques,

  • Réalisation de projets R&D en bio-informatique.

Prestations

  • Analyses NGS quantitatives (RNA-seq, Chip-seq) : profils d’expression, analyses différentielles, rapports et outils de visualisation,

  • Analyses NGS qualitatives (RNA-seq, Exome) : recherche de SNV ; indels ; variants d’épissage ; ARN de fusion; reconstruction de transcrits ; ARN non codants …

  • Autres prestations NGS sur devis : développements R&D ciblés, data mining et machine learning, analyses de données en accès public, partage de données (interface Web).

Expertise - conseil

  • Conception et design de projets de séquençage haut-débit (NGS).

  • Proposition et évaluation des outils d’analyses par approche de benchmarking.

Mise à disposition de moyens

  • Mise à disposition d’espace de calcul sur demande.

Formations

  • Organisation de formations pour les biologistes et les bio-informaticiens.

  • Analyse de données NGS et leur exploitation : initiation aux analyses primaires de données NGS, outils d’analyse différentielle, initiation linux…