Bio2m Formation


Nous organisons plusieurs formations régulièrement qui sont orientées pour les biologistes.

Recherche de mutation génomiques dans des gènes codants pour des protéines

  • Nouvelle Session pour 2020
  • Formateurs: Anthony Boureux et Thérèse Commes (Bio2M), Sacha Beaumeunier (SeqOne), Olivier Arduin (CHU)
  • Session de 4 jours
  • Session 2018

Théorie

  • A partir d’échantillon d’ADN, apprendre à choisir le type de préparation des échantillons en fonction du nombre d’échantillons, d’exons et de gènes
  • Choisir le type de séquençage en fonction des différents paramêtres
  • Comment obtenir les variants (choix nettoyage des reads, choix des mapper, choix du variant-caller)
  • Comment filtrer les variants obtenus pour trouver la/les mutations probables

Pratique

Sur machine :

  • Réaliser le controle qualité des résultats de séquençage.
  • Réaliser les étapes pour aligner les reads, obtenir les variants puis les filtrer.

Initiation à R pour les biologistes

  • Session en 3x 3h sur machines
  • Formateurs: Anthony Boureux et Benoit Guibert (Bio2M)

  • Les bases de R (syntaxe, fonction, type variable)
  • Réaliser des sélections, modifications de données
  • Réaliser des graphes