Escalate - ITMO MIC 2024-2027

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Indexation à très très haut débit

• Projet financé par l’ l’ITMO Cancer d’Aviesan dans le cadre de la Stratégie Décennale de lutte contre les cancers 2021-2030,

Réunion de travail 5 mars

Accueil/café 9h, Démarrage 9h30.

Méthodologie : 9h30 à 10h15

• Lille : Antoine et Camille
• Data : 10h15-11h
  • Montpellier : le point sur les données disponibles, Procédures de nettoyage et analyse qualité, index (Anthony)
  • Saclay: correction automatique des metadata SRA pour le cancer (Daniel/Fiona)

Pause : 11-11h15

• Requête/Transipedia: 11h15/12h15

  • Montpellier : Procédures de k-mers (design, normalisation …) (Chloé/Thrérèse)
  • Montpellier : ML et k-mers (Raissa)
  • Montpellier: le point sur Transipedia (Benoit)

Repas : 12h15/13h30

Discussions : 13h30/14h30 - Tous

Plan de travail des 6 prochains mois 15-16h: Antoine

Participants

Lille - Cristal

• Antoine Limasset
• Camille Marchet
• Yohan Hernandez-Courbevoie

Paris-Saclay - I2BC

• Daniel Gautheret
• Mélina Gallopin
• Fionai Hak

Montpellier - Bio2M

• Thérèse Commes
• Nicolas Gilbert
• Jerome Reboul
• Benoit Guibert
• Anthony Boureux
• Raïssa Lorena
• Camelia Sennaoui