Bio2m Plateform

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Cette plateforme fait partie des plateformes recherches du CHU de Montpellier.

Collaboration de recherche ou de R&D

• Partenariats scientifiques,

• Réalisation de projets R&D en bio-informatique.

Prestations

• Analyses NGS quantitatives (RNA-seq, Chip-seq) : profils d’expression, analyses différentielles, rapports et outils de visualisation,

• Analyses NGS qualitatives (RNA-seq, Exome) : recherche de SNV ; indels ; variants d’épissage ; ARN de fusion; reconstruction de transcrits ; ARN non codants …

• Autres prestations NGS sur devis : développements R&D ciblés, data mining et machine learning, analyses de données en accès public, partage de données (interface Web).

Expertise - conseil

• Conception et design de projets de séquençage haut-débit (NGS).

• Proposition et évaluation des outils d’analyses par approche de benchmarking.

Mise à disposition de moyens

• Mise à disposition d’espace de calcul sur demande.

Formations

• Organisation de formations pour les biologistes et les bio-informaticiens.

• Analyse de données NGS et leur exploitation : initiation aux analyses primaires de données NGS, outils d’analyse différentielle, initiation linux…