Bio2m Infrastructure

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Serveur

• 1 serveur de calcul large mémoire : Dell R740xd 96 coeurs (bi-CPU Xeon Gold 5220R CPU @ 2.20GHz) et 377 Go de RAM
• 2 serveurs large memory (Dell R450 - 700 Go de RAM)
• 1 serveur de calcul large mémoire : Dell R620 32 coeurs (bi-CPU Xeon E5-2670 @2.60GHz 8c HT) et 320 Go de RAM
• 1 serveur de services (VM, dhcp, NFS, …) : Dell R730xd 40 coeurs (bi-CPU Xeon E5-2650 @2.30GHz 10c HT), 256 Go de RAM et 40 To de disques SAS
• 1 serveur de stockage de 40 To

Cluster

• 14 noeuds de calcul R630 : 48 coeurs et 192 Go de RAM
• 2 serveurs d’io (SAS / Infiniband)
• 1 SAN 2x (MD3460/MD3060) pour 300 To partagé

Autres Modes de calcul

• Utilisateur du mésocentre de calcul de Montpellier MESO-ISDM

Données publiques :

Nous avons localement plusieurs séries de données publiques :

• LEUCEGENE (patients LAM) : 500 RNA-Seq, pour 5 To de fichiers fastq.gz
• Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) : 1019 RNA-Seq, pour 11 To de fichiers fastq.gz
• GTEx : 12000 RNA-Seq multiples tissus d’individus normaux