Bio2m Formation
Nous organisons plusieurs formations régulièrement qui sont orientées pour les biologistes.
Recherche de mutation génomiques dans des gènes codants pour des protéines
- Nouvelle Session pour 2020
- Formateurs: Anthony Boureux et Thérèse Commes (Bio2M), Sacha Beaumeunier (SeqOne), Olivier Arduin (CHU)
- Session de 4 jours
- Session 2018
Théorie
- A partir d’échantillon d’ADN, apprendre à choisir le type de préparation des échantillons en fonction du nombre d’échantillons, d’exons et de gènes
- Choisir le type de séquençage en fonction des différents paramêtres
- Comment obtenir les variants (choix nettoyage des reads, choix des mapper, choix du variant-caller)
- Comment filtrer les variants obtenus pour trouver la/les mutations probables
Pratique
Sur machine :
- Réaliser le controle qualité des résultats de séquençage.
- Réaliser les étapes pour aligner les reads, obtenir les variants puis les filtrer.
Initiation à R pour les biologistes
